В соответствии с приказом Федерального казначейства от 18 апреля 2016 г. № 94 «Об организационно-штатной структуре управлений Федерального казначейства по субъектам Российской Федерации» в организационно-штатной структуре Управления Федерального казначейства по Приморскому краю созданы структурные подразделения для осуществления полномочий Федерального казначейства по контролю и надзору в финансово-бюджетной сфере, по внешнему контролю качества работы аудиторских организаций:
- контрольно-ревизионный отдел в социальной сфере, сфере межбюджетных отношений и социального страхования;
- контрольно-ревизионный отдел в сфере развития экономики;
- организационно-аналитический отдел;
- контрольно-ревизионный отдел в сфере деятельности силовых ведомств и судебной системы.